En el año de 1966, el municipio de Cuscatancingo se beneficia con la apertura del Colegio Parroquial San Luis siendo su fundador el Padre René Rivera, quien en ese tiempo fungía como Director de la misma. De esta forma, el 7 de febrero de ese mismo año dieron inicio las clases con un promedio de 600 estudiantes, 331 niñas y 269 niños.

Inicialmente se contaba únicamente con cuatro salones, pero gracias a la primera Directiva de Padres de Familia se logró construir dos aulas más. En este año también se contó con la visita de Monseñor Luis Chávez y González a quien se le solicitó el permiso para que funicione séptimo grado el primero de noviembre de ese mismo año.

Se presenta dicho acuerdo donde se autoriza en el año 1972, la Madre Ana María Zeledón Blandón se hizo cargo como Directora General.

El 4 de junio de 1985 se firmó un nuevo convenio de Cooperación Técnica entre el Ministerio de Educación y la Iglesia Católica de El Salvador.

En Septiembre de 2004 se inicia el proceso de acreditación y la actualización efectiva de sus directoras, docentes, personal administrativo y asesores por la Universidad del Tepeyac, México.